化脓性颅骨骨髓炎大多数来自直接感染，如开放性颅骨骨折，开颅或颅骨钻孔术、颅骨牵引术后感染等，以及放射性治疗，皮肤移植失败等使颅骨裸露而遭受感染。颅骨骨髓炎可发生于颅骨的任何部位，但以颅盖的额、顶骨最为多见。