泌尿及生殖道衣原体感染称为衣原体尿路感染。衣原体所致的非淋球菌性尿路感染主要由性交传播，潜伏期1～3周。使人类致病的衣原体有3种即生殖道沙眼衣原体(CT)、鹦鹉热衣原体和肺炎衣原体。40%～50%的非淋菌性尿道炎是由沙眼衣原体引起。