病毒性咽炎系病毒所引起的咽部急性感染多在咽部、口腔粘膜及其周围皮肤发生疱疹，也可发生于角膜及外生殖器。病变为上皮细胞水肿、膨胀，使表皮的棘细胞层隆起，形成水疱，内含大量多核白细胞及血清，细胞核内有嗜酸性包函体，水疱很快破裂，形成一浅溃疡，表面覆有炎性细胞、红细胞或坏死组织。应与口疮性口炎，多形渗出性红斑，坏死性口腔炎，带状疱疹相鉴别。如带状疱疹是由水痘-带状疱疹病毒引起的急性感染性皮肤病。对此病毒无免疫力的儿童被感染后，发生水痘。部分患者被感染后成为带病毒者而不发生症状。