致病因子作为抗原，如乙肝病毒(HBV)，丙肝病毒(HCV)，日本血吸虫卵分泌的可溶性抗原(SEA)物质，均主要通过免疫反应而造成肝损害。直接作用于肝细胞致肝损害，如四氯化碳。二者兼之的某些药物与毒物，肝细胞损害与炎症反应均是肝组织对致病因子的应答反应，但炎症反应，肝细胞再生与修复实为抗损伤反应，通常按坏死→炎症→纤维增生的模式进行，现认为肝脏的炎症(慢性肝损伤)在启动肝纤维化形成过程中起核心作用。

近年来人们将免疫效应细胞和相关的细胞如成纤维细胞和内皮细胞产生的，具有传递不同细胞与组织之间相互作用的激素样蛋白统称细胞因子(包括淋巴因子及单核因子)或称肽类调节因子，各种细胞因子除具有多种生物活性外，彼此之间还有诱生，受体调节及生物学效应上的相互作用，从而构成一个关系复杂的细胞因子网络，经研究已知细胞因子参与肝纤维化形成的调节，一旦细胞因子网络失调，在肝纤维化形成中必然起重要作用。